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经颅磁刺激的副作用和危害主要有以下方面1癫痫发作经颅磁刺激治疗，会释放出相应的频率，刺激大脑组织，在治疗的过程中可能会诱发癫痫发作3记忆力下降经颅磁刺激是指通过磁刺激大脑皮层，调节大脑功能，改善大脑血液循环，促进大脑新陈代谢，但如果患者长期进行治疗，会导致脑部出现疲劳的现象。

经颅磁刺激的副作用是对于癫痫病史的患者可能触发癫痫的发作，对于体内植入金属器检，如钢板支架起搏器者慎用经颅磁刺激。