然而，磁力珠虽然看似有趣无害，却隐藏着不容忽视的安全隐患特别是对儿童来说，由于他们的好奇心强且安全意识薄弱，很容易将磁力珠误吞入体内磁力珠的强磁性使得它们在消化道内会相互吸引，可能导致消化道堵塞穿孔等严重后果如果多颗磁力珠被误吞，它们可能会在肠道内相互吸引，夹住肠壁，引起肠。
孩子会面临休克，或者直接死亡的危险生活中很多小孩子在吃了磁力珠之后，身体并没有立即作出一系列的反应，有的在几天之后出现了一些流感的情况，比如呕吐腹泻等，给家长造成了一定的迷惑性，一旦孩子的身体出现了胃穿孔等各种严重的症状，再送到医院治疗已经失去了最佳的抢救时间，因为磁力珠事件引发的。
肠道损伤即使儿童没有吞下磁力珠，如果他们把磁力珠放在嘴里并让它们相互吸引，也可能导致牙齿或其他口腔组织的损伤此外，如果儿童将磁力珠放在鼻子或耳朵里，可能会导致这些部位的损伤窒息风险如果儿童在玩耍时不小心将磁力珠吸入气管，可能会导致窒息这是一个非常严重的情况，需要立即进行急救铅。
